PCR扩增检验实验室原则上分(fēn)為(wèi)四个单独的工作區(qū)域：试剂贮存和准备區(qū)、标本制备區(qū)、扩增反应混合物(wù)配制和扩增區(qū)、扩增产物(wù)分(fēn)析區(qū)。為(wèi)避免交叉污染，进入各个工作區(qū)域必须严格遵循单一方向进行，即只能(néng)从试剂贮存和准备區(qū)→标本制备區(qū)→扩增反应混合物(wù)配制和扩增區(qū)→扩增产物(wù)分(fēn)析區(qū)。
2实验室空调通风系统设计及压力控制
并没有(yǒu)严格的净化要求，但是為(wèi)避免各个实验區(qū)域间交叉污染的可(kě)能(néng)性，宜采用(yòng)全送全排的气流组织形式。同时，要严格控制送、排风的比例以保证各实验區(qū)的压力要求。
2.1PCR试剂贮存和准备區(qū)
该实验區(qū)主要进行的操作為(wèi)贮存试剂的制备、试剂的分(fēn)装和主反应混合液的制备。试剂和用(yòng)于样品制作的材料应直接运送至该區(qū)，不得经过其他(tā)區(qū)域。试剂原材料必须贮存在本區(qū)内，并在本區(qū)内制备成所需的贮存试剂。
对与气流压力的控制，本區(qū)并没有(yǒu)严格的要求。
2.2PCR标本制备區(qū)
该區(qū)域主要进行的操作為(wèi)样本的保存、核酸(RNA、DNA)提取、贮存及其加入至扩增反应管和测定DNA的合成。
本區(qū)的压力梯度要求為(wèi)：相对于邻近區(qū)域為(wèi)正压，以避免从邻近區(qū)进入本區(qū)的气溶胶污染。另外，由于在加样操作中可(kě)能(néng)会发生气溶胶所致的污染，所以应避免在本區(qū)内不必要的走动。
2.3扩增反应混合物(wù)配制和扩增區(qū)
该區(qū)域主要进行的操作為(wèi)DNA扩增。此外，已制备的DNA模板 (来自样本制备區(qū))的加入和主反应混合液(来自试剂贮存和制备區(qū))制备成反应混合液等也可(kě)在本區(qū)内进行。
本區(qū)的压力梯度要求為(wèi)：相对于邻近區(qū)域為(wèi)负压，以避免气溶胶从本區(qū)漏出。為(wèi)避免气溶胶所致的污染，应尽量减少在本區(qū)内的不必要的走动。个别操作如加样等应在超净台内进行。
2.4扩增产物(wù)分(fēn)析區(qū)
该區(qū)域主要进行的操作為(wèi)扩增片段的测定。
本區(qū)是最主要的扩增产物(wù)污染来源，因此对本區(qū)的压力梯度的要求為(wèi)：相对于邻近區(qū)域為(wèi)负压，以避免扩增产物(wù)从本區(qū)扩散至其它區(qū)域。
3污染的预防与控制
PCR实验室设计的核心问题是如何避免污染。在实际工作中，常见的有(yǒu)以下几种污染类型：扩增产物(wù)的污染；天然基因组DNA的污染；试剂的污染以及标本间的污染。由于一旦发生污染，实验就必须停止，直到找到污染源為(wèi)止，而且实验结果必须作废，需重新(xīn)进行实验。所以发生污染后再围绕实验室来寻找污染源不但耗时而且繁琐，浪费人力物(wù)力。因此要避免污染，首先应是预防，而不是排除。
3.1工作區(qū)域的严格划分(fēn)
（1）各个实验區(qū)域设置合理(lǐ)；
（2）各个实验區(qū)域要有(yǒu)明显的标记（如醒目的门牌或不同的地面颜色等），以避免各个不同实验區(qū)域设备物(wù)品、试剂等发生混淆。
3.2合理(lǐ)的系统设置
（1）合理(lǐ)的空调通风系统设置，尽量采用(yòng)全送全排的空调系统；
（2）严格的气流压力控制，保证不同的实验區(qū)内不同的压力要求。
3.3 规范的操作
（1）扩增检验实验室的技术人员必须进行上岗培训，经培训合格后才能(néng)从事临床基因扩增检验的工作；
（2）在实验操作过程中，操作者必须戴手套，并经常更换。此外，操作中使用(yòng)一次性帽子也是一个有(yǒu)效地防止污染的措施；
（3）清洁工作及时、正确。实验工作结束后，必须立即对本區(qū)进行清洁。除常规的消毒液體(tǐ)对表面进行擦拭消毒或紫外線(xiàn)灯的照射消毒外，对一些实验设备还应进行高压消毒处理(lǐ)。
3.4严格的管理(lǐ)
（1）严格控制进出实验室的人员。与实验无关的人员不得随意进出实验室，有(yǒu)条件的情况下要设置独立的通道和进出整个实验區(qū)的门；
（2）尽量减少在实验區(qū)内不必要的走动以减少交叉污染的可(kě)能(néng)性。
（3）扩增产物(wù)分(fēn)析區(qū)是最主要的扩增产物(wù)污染来源，废液不能(néng)在实验室中倾倒，必须经消毒液浸泡消毒后在遠(yuǎn)离实验室的地方弃掉，用(yòng)过的吸头等一次性材料也应经消毒液浸泡消毒后统一处理(lǐ)，如焚烧等；
（4）扩增产物(wù)分(fēn)析區(qū)可(kě)能(néng)会用(yòng)到某些可(kě)致基因突变和有(yǒu)毒物(wù)质，应特别注意实验人员的安全防护。
3.5完备的实验室配套设施
完备的实验室配套设施是保证实验工作的必要条件，应根据各个实验室实验内容的不同配备相应的设备和仪器，如超净工作台、离心机、加样器等。